从共价G12C抑制剂到泛RAS(ON)三元复合物分子胶——Sotorasib、Adagrasib与Daraxonrasib的机制对比与结构基础
| 对比维度 | Sotorasib & Adagrasib(第一代) | Daraxonrasib(下一代) |
|---|---|---|
| 靶向构象 | RAS(OFF) – GDP结合非活性状态 | RAS(ON) – GTP结合活性状态 |
| 结合机制 | 共价结合于Switch-II口袋(SII-P) | 非共价分子胶水,形成CypA–药物–RAS三元复合物 |
| 结合口袋 | Switch-II口袋(SII-P) | Switch I/II(SWI/SWII)与CypA形成的复合口袋 |
| 选择性谱 | 仅针对KRAS G12C突变 | 覆盖KRAS、NRAS、HRAS多种突变及野生型 |
| CypA依赖性 | 不依赖CypA | 严格依赖CypA形成三元复合物 |
| 对GTP酶活性影响 | 稳定GDP结合非活性状态 | 增强GTP水解,促进向非活性状态转变 |
在野生型KRAS中,12号密码子为甘氨酸(Glycine)。G12C突变将其替换为半胱氨酸(Cysteine),该残基具有异常高的亲核性,使不可逆共价键的形成成为可能。
| 结合特征 | Sotorasib | Adagrasib |
|---|---|---|
| 共价结合位点 | SII-P的Cys12 | SII-P的Cys12 |
| 对H95的依赖性 | 较低 | 强烈(不可替代) |
| NRAS G12C效力 | KRAS G12C的5倍 | 无活性 |
| HRAS G12C活性 | 有活性 | 无活性 |
| H95突变耐药 | ✓ 不产生 | ✗ 产生耐药 |
| Y96突变耐药 | ✗ 交叉耐药 | ✗ 交叉耐药 |
| 肿瘤类型 | G12C抑制剂客观缓解率 | 主要限制因素 |
|---|---|---|
| NSCLC(非小细胞肺癌) | 37–43% | 多数患者12个月内进展 |
| PDAC(胰腺导管腺癌) | <10% | G12C突变仅占5%病例 |
| CRC(结直肠癌) | 约7% | EGFR激活导致野生型RAS补偿 |
数值越小表示结合亲和力越强(Kd, nM)
| 条件 | CypA单独 | Daraxonrasib单独 | CypA + Daraxonrasib |
|---|---|---|---|
| 能否结合RAS(ON) | ✗ 不能 | ✗ 不能 | ✓ 形成三元复合物 |
| 能否阻断效应蛋白 | ✗ 不能 | ✗ 不能 | ✓ 空间位阻阻断 |
| 能否增强GTP水解 | ✗ 不能 | ✗ 不能 | ✓ GAP样效应 |
| 核心机制 | Sotorasib | Adagrasib | Daraxonrasib |
|---|---|---|---|
| 结合状态 | GDP结合RAS(OFF) | GDP结合RAS(OFF) | GTP结合RAS(ON) |
| 结合机制 | 共价键 | 共价键 | 非共价分子胶 |
| 结合口袋 | Switch-II口袋(SII-P) | Switch-II口袋(SII-P) | SWI/SWII+CypA复合口袋 |
| CypA依赖性 | ✗ 无 | ✗ 无 | ✓ 严格依赖 |
| 共价键形成 | ✓ 与Cys12 | ✓ 与Cys12 | ✗ 非共价 |
| 对GTP酶影响 | 无直接作用 | 无直接作用 | 增强(GAP样效应) |
| 对信号影响 | 被动锁定非活性态 | 被动锁定非活性态 | 主动阻塞活性态并促进失活 |
Switch-II口袋(SII-P)位于KRAS的Switch II区域与α3-螺旋之间,是一个受KRAS构象状态调控的变构口袋。
Daraxonrasib的结合口袋是一种新形成的复合口袋,横跨CypA和RAS的Switch I/II(SWI/SWII)区域。
| 参与三元复合物的RAS残基 | 在RAS中的位置 | 在结合中的角色 |
|---|---|---|
| Pro34 | Switch I区域 | 与Daraxonrasib直接相互作用 |
| Ile36 | Switch I区域 | 提供疏水接触表面 |
| Gln61 | Switch II区域 | 氢键形成的关键残基 |
| Tyr64 | Switch II区域 | 参与疏水堆积作用(Y64替换改变复合物组装) |
| 结合界面残基/特征 | Sotorasib | Adagrasib | Daraxonrasib |
|---|---|---|---|
| Cys12(G12C突变) | ✓ 共价结合 | ✓ 共价结合 | ✗ 不直接结合 |
| His95(H95) | 较低依赖,突变不耐药 | 强依赖,突变导致耐药 | 不涉及 |
| Tyr96(Y96) | 突变导致交叉耐药 | 突变导致交叉耐药 | 不直接涉及 |
| Pro34 | ✗ 不涉及 | ✗ 不涉及 | ✓ 复合口袋相互作用 |
| Ile36 | ✗ 不涉及 | ✗ 不涉及 | ✓ 复合口袋相互作用 |
| Gln61 | ✗ 不涉及 | ✗ 不涉及 | ✓ 复合口袋相互作用 |
| Tyr64 | ✗ 不涉及 | ✗ 不涉及 | ✓ 复合口袋相互作用 |
| 结合口袋特性 | 共价G12C抑制剂 | Daraxonrasib |
|---|---|---|
| 主要口袋 | Switch-II口袋(SII-P) | SWI/SWII + CypA复合口袋 |
| 结合位置描述 | Switch II和α3-螺旋之间 | 跨越CypA和RAS的SWI/SWII区域 |
| 口袋形状 | 疏水空腔(可因结合而开放) | 新形成的复合界面 |
| 共价键形成 | ✓ 与Cys12形成 | ✗ 不需要共价键 |
| 口袋形成条件 | G12C突变导致的空腔 | CypA结合和RAS(ON)状态共同创建 |
| 构象状态依赖 | GDP结合OFF态 | GTP结合ON态 |
| 覆盖范围 | Sotorasib | Adagrasib | Daraxonrasib |
|---|---|---|---|
| KRAS G12C | ✓ 完全覆盖 | ✓ 完全覆盖 | ✓ 完全覆盖 |
| KRAS G12D | ✗ 无覆盖 | ✗ 无覆盖 | ✓ 完全覆盖 |
| KRAS G12V | ✗ 无覆盖 | ✗ 无覆盖 | ✓ 完全覆盖 |
| KRAS G12A | ✗ 无覆盖 | ✗ 无覆盖 | ✓ 完全覆盖 |
| NRAS/HRAS | 仅NRAS G12C有活性 | ✗ 无覆盖 | ✓ 完全覆盖 |
| 野生型RAS | ✗ 无覆盖 | ✗ 无覆盖 | ✓ 完全覆盖 |
| 药物 | 代号 | 选择性 | 开发阶段 |
|---|---|---|---|
| Daraxonrasib | RMC-6236 | 泛RAS(ON)多选择性 | 三期完成 |
| Elironrasib | RMC-6291 | G12C选择性RAS(ON) | 临床开发中 |
| Zoldonrasib | RMC-9805 | G12D选择性RAS(ON) | 临床开发中 |
| 突变类型 | 对Sotorasib的影响 | 对Adagrasib的影响 | 对Daraxonrasib的影响 |
|---|---|---|---|
| H95突变 | ✓ 通常保持敏感 | ✗ 导致强耐药 | 不适用(靶点不同) |
| Q99突变 | ✓ 通常保持敏感 | ✗ 导致强耐药 | 不适用(靶点不同) |
| G13D突变 | ✓ 保持敏感 | ✗ 导致强耐药 | 不适用(靶点不同) |
| R68S突变 | ✗ 交叉耐药 | ✗ 交叉耐药 | 不适用(靶点不同) |
| Y96突变 | ✗ 交叉耐药 | ✗ 交叉耐药 | 不适用(靶点不同) |
| 对比维度 | Sotorasib | Adagrasib | Daraxonrasib |
|---|---|---|---|
| 机制 | 共价G12C OFF抑制剂 | 共价G12C OFF抑制剂 | 三元复合物RAS(ON)分子胶 |
| 靶向构象 | GDP结合RAS(OFF) | GDP结合RAS(OFF) | GTP结合RAS(ON) |
| 结合口袋 | Switch-II口袋(SII-P) | Switch-II口袋(SII-P) | SWI/SWII+CypA复合口袋 |
| CypA依赖性 | ✗ 无 | ✗ 无 | ✓ 严格依赖 |
| 共价键 | ✓ 与Cys12 | ✓ 与Cys12 | ✗ 非共价 |
| 选择性 | KRAS G12C(兼NRAS/HRAS G12C) | 仅KRAS G12C | KRAS/NRAS/HRAS多种突变及野生型 |
| H95依赖性 | 较低 | 强烈 | 不适用 |
| 耐药-H95突变 | ✓ 不产生 | ✗ 产生 | 不适用 |
| 对GTP酶影响 | 无直接作用 | 无直接作用 | 增强(GAP样效应) |
| 主要适应症 | KRAS G12C NSCLC | KRAS G12C NSCLC | RAS突变PDAC(三期完成) |
| PDAC临床结果 | ✗ 无效 | ✗ 无效 | ✓ mOS 13.2月 vs 6.7月 |